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上記のようにIneligible Devicesとなり実機が選択できなくなる現象ですが、カッコ内にdeployment targetとある場合は、実機のOSバージョンとTARGETSのターゲットOSバージョンが不適切なことが原因です。
[TARGETS]->[Build Settings]->[Deployment]->[iOS Deployment Targert]項目を実機のOSバージョンに対応したTARGETSのOSバージョンに設定すれば解決できます。
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ちなみに、上記画像の例は、iOS Deployment TargertがiOS8のTARGETS（スキーム）で、iOS7.xを載せたiPhone5を選択しようとした場合です。
＜補足＞
Ineligible Devices (OS version)の場合は、以下を参照してください。
Xcode6で実機が認識されずにIneligible Devices (OS version)になる場合の対処